Патогены​: найти и обезвредить

При работе с проектом мы использовали специальные тест-системы. Часть из них были готовые, а часть мы написали сами. 
Тест-система состоит из двух праймеров, служащих затравкой для полимеразы, которая производит удвоение цепи ДНК, и ДНК-зонда, который при прохождении полимеразы излучает квант света с длиной волны, отличной от принятой. 
Для написания тест-систем мы с помощью базы секвенированных геномов (NCBI) находили фрагмент ДНК специфичный для данного патогена. Затем в программе Oligo подбирали праймеры и ДНК-зонды следуя специальным правилам, относящимся к температуре плавления и длине олигонуклеотидов. 
Мы создали тест-системы для определения наличия ДНК острицы, амёбы гистолитики, лямблии, циклоспоры. Две из них (амёба гистолитика и циклоспора) не имеют аналогов на рынке. 
Сами по себе тест-системы используются в методе полимеразной цепной реакции, а этот метод позволяет проводить высокоточный анализ материала всего за несколько часов, причём это относительно недорогой способ определения наличия патогенов. Благодаря этим качествам такие тест-системы могут получить распространение в поликлиниках и больницах.